More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1695 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03038  argininosuccinate synthase  90.25 
 
 
447 aa  843    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0534  Argininosuccinate synthase  90.48 
 
 
447 aa  845    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0414  argininosuccinate synthase  74.72 
 
 
449 aa  693    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2408  argininosuccinate synthase  100 
 
 
455 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3035  argininosuccinate synthase  78.03 
 
 
446 aa  725    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3364  argininosuccinate synthase  90.25 
 
 
447 aa  843    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2553  argininosuccinate synthase  78.18 
 
 
445 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415534  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3766  argininosuccinate synthase  78.1 
 
 
446 aa  715    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3608  argininosuccinate synthase  90.48 
 
 
448 aa  846    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00639067  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2505  argininosuccinate synthase  100 
 
 
455 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0238  argininosuccinate synthase  79.01 
 
 
445 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3363  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
446 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0305  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
446 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2233  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
448 aa  712    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5242  argininosuccinate synthase  80.05 
 
 
441 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4149  argininosuccinate synthase  89.23 
 
 
448 aa  846    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3480  argininosuccinate synthase  89.34 
 
 
447 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0501  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
446 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0397  argininosuccinate synthase  78.78 
 
 
445 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3599  argininosuccinate synthase  90.02 
 
 
447 aa  842    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2399  argininosuccinate synthase  79.23 
 
 
444 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0086  argininosuccinate synthase  89.18 
 
 
450 aa  837    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5499  argininosuccinate synthase  78.78 
 
 
444 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.619604  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2423  argininosuccinate synthase  79.14 
 
 
445 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4430  argininosuccinate synthase  91.34 
 
 
448 aa  844    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2829  argininosuccinate synthase  78.91 
 
 
445 aa  723    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.83026 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0279  argininosuccinate synthase  78.96 
 
 
446 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3596  argininosuccinate synthase  79.23 
 
 
445 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0090  argininosuccinate synthase  76.35 
 
 
445 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0319  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
446 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.463293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2689  argininosuccinate synthase  80.37 
 
 
447 aa  712    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0031  argininosuccinate synthase  76.13 
 
 
445 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1599  argininosuccinate synthase  79.46 
 
 
446 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3585  argininosuccinate synthase  89.57 
 
 
447 aa  836    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2061  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
446 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0713  argininosuccinate synthase  77.03 
 
 
445 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.830506  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5926  argininosuccinate synthase  79.37 
 
 
441 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3809  argininosuccinate synthase  79.41 
 
 
445 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279465  normal  0.39816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4651  argininosuccinate synthase  79.41 
 
 
445 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0527  argininosuccinate synthase  90.25 
 
 
447 aa  843    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000123747 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1362  argininosuccinate synthase  81.55 
 
 
444 aa  746    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.814914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4494  argininosuccinate synthase  90.25 
 
 
447 aa  844    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.976918  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3657  argininosuccinate synthase  90.25 
 
 
447 aa  844    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0900024  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5452  argininosuccinate synthase  79.01 
 
 
445 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0068  argininosuccinate synthase  90.09 
 
 
449 aa  837    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2224  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
446 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712669  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0912  argininosuccinate synthase  77.12 
 
 
446 aa  700    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5014  argininosuccinate synthase  79.68 
 
 
445 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3712  argininosuccinate synthase  79.41 
 
 
445 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281609  normal  0.0920817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3468  argininosuccinate synthase  90.48 
 
 
447 aa  845    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202724  normal  0.808331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4776  argininosuccinate synthase  78.86 
 
 
444 aa  722    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3549  argininosuccinate synthase  89.8 
 
 
447 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110104  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1695  argininosuccinate synthase  100 
 
 
455 aa  944    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0802625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1856  argininosuccinate synthase  79.05 
 
 
447 aa  727    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1082  argininosuccinate synthase  81.82 
 
 
445 aa  725    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2743  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
448 aa  712    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167871  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3647  argininosuccinate synthase  89.34 
 
 
447 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3032  argininosuccinate synthase  78.05 
 
 
446 aa  731    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3461  argininosuccinate synthase  76.52 
 
 
453 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02989  hypothetical protein  90.25 
 
 
447 aa  843    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3479  argininosuccinate synthase  89.57 
 
 
447 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2397  argininosuccinate synthase  67.51 
 
 
473 aa  624  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1767  argininosuccinate synthase  65.98 
 
 
487 aa  611  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0627257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2046  argininosuccinate synthase  65.98 
 
 
481 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0297516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4125  argininosuccinate synthase  67.37 
 
 
475 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435339  hitchhiker  0.0000508135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8647  argininosuccinate synthase  65.36 
 
 
488 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.934926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2201  argininosuccinate synthase  64.97 
 
 
482 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3484  argininosuccinate synthase  64.07 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627119  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9344  Argininosuccinate synthase  63.76 
 
 
482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2474  argininosuccinate synthase  67.38 
 
 
477 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0765  argininosuccinate synthase  62.34 
 
 
470 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00834768  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10110  argininosuccinate synthase  66.04 
 
 
477 aa  592  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2680  argininosuccinate synthase  59.18 
 
 
451 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.015666 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3184  argininosuccinate synthase  59.72 
 
 
450 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.182109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3085  argininosuccinate synthase  59.95 
 
 
450 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0020756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3278  argininosuccinate synthase  59.72 
 
 
450 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105122  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4163  argininosuccinate synthase  32.38 
 
 
404 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  31.19 
 
 
409 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  30.85 
 
 
401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  30.93 
 
 
409 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  31.39 
 
 
418 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00700  argininosuccinate synthase, putative  33.51 
 
 
429 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34492  argininosuccinate synthetase  31.81 
 
 
416 aa  167  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.491384  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  32.61 
 
 
416 aa  166  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  32.69 
 
 
403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  32 
 
 
403 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  31.23 
 
 
397 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  31.26 
 
 
403 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  31.31 
 
 
403 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  30.7 
 
 
407 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  30.77 
 
 
399 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  32.45 
 
 
396 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  30 
 
 
410 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  30.96 
 
 
401 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  31.8 
 
 
401 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  29.25 
 
 
405 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  31.3 
 
 
397 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  29.56 
 
 
399 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  31.01 
 
 
400 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  30.69 
 
 
405 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>