More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2553 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03038  argininosuccinate synthase  77.73 
 
 		 447 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0534  Argininosuccinate synthase  77.95 
 
 		 447 aa  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3647  argininosuccinate synthase  76.82 
 
 		 447 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3468  argininosuccinate synthase  77.95 
 
 		 447 aa  718    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202724  normal  0.808331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2553  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 445 aa  916    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3035  argininosuccinate synthase  86.91 
 
 		 446 aa  803    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0305  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02989  hypothetical protein  77.73 
 
 		 447 aa  716    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3364  argininosuccinate synthase  77.73 
 
 		 447 aa  716    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2061  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3363  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3596  argininosuccinate synthase  81.26 
 
 		 445 aa  755    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3608  argininosuccinate synthase  77.5 
 
 		 448 aa  714    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00639067  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0527  argininosuccinate synthase  77.73 
 
 		 447 aa  716    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000123747 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3480  argininosuccinate synthase  76.82 
 
 		 447 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5242  argininosuccinate synthase  80.23 
 
 		 441 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3461  argininosuccinate synthase  84.68 
 
 		 453 aa  786    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0501  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0414  argininosuccinate synthase  75.91 
 
 		 449 aa  688    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2408  argininosuccinate synthase  78.18 
 
 		 455 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2399  argininosuccinate synthase  80.9 
 
 		 444 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2233  argininosuccinate synthase  92.62 
 
 		 448 aa  854    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2423  argininosuccinate synthase  97.98 
 
 		 445 aa  901    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2224  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712669  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5014  argininosuccinate synthase  80.81 
 
 		 445 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3809  argininosuccinate synthase  80.81 
 
 		 445 aa  750    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279465  normal  0.39816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3585  argininosuccinate synthase  77.05 
 
 		 447 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0068  argininosuccinate synthase  78.41 
 
 		 449 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0279  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0912  argininosuccinate synthase  78.08 
 
 		 446 aa  727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0090  argininosuccinate synthase  81.98 
 
 		 445 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2689  argininosuccinate synthase  85.49 
 
 		 447 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0031  argininosuccinate synthase  81.31 
 
 		 445 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1599  argininosuccinate synthase  85.17 
 
 		 446 aa  792    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4430  argininosuccinate synthase  78 
 
 		 448 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0713  argininosuccinate synthase  82.21 
 
 		 445 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.830506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5926  argininosuccinate synthase  80.23 
 
 		 441 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3599  argininosuccinate synthase  77.73 
 
 		 447 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4651  argininosuccinate synthase  80.81 
 
 		 445 aa  750    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4494  argininosuccinate synthase  77.95 
 
 		 447 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.976918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1362  argininosuccinate synthase  84.2 
 
 		 444 aa  783    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.814914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5499  argininosuccinate synthase  80.45 
 
 		 444 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.619604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3479  argininosuccinate synthase  77.05 
 
 		 447 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3549  argininosuccinate synthase  77.27 
 
 		 447 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0238  argininosuccinate synthase  81.31 
 
 		 445 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5452  argininosuccinate synthase  81.26 
 
 		 445 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2829  argininosuccinate synthase  98.2 
 
 		 445 aa  902    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.83026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3766  argininosuccinate synthase  84.2 
 
 		 446 aa  770    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3657  argininosuccinate synthase  77.95 
 
 		 447 aa  718    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0900024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3712  argininosuccinate synthase  80.81 
 
 		 445 aa  750    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281609  normal  0.0920817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4149  argininosuccinate synthase  78 
 
 		 448 aa  721    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0086  argininosuccinate synthase  77.3 
 
 		 450 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1695  argininosuccinate synthase  78.18 
 
 		 455 aa  717    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0802625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2505  argininosuccinate synthase  78.18 
 
 		 455 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0397  argininosuccinate synthase  82.88 
 
 		 445 aa  773    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0319  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.463293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1856  argininosuccinate synthase  89.62 
 
 		 447 aa  830    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1082  argininosuccinate synthase  83.48 
 
 		 445 aa  763    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2743  argininosuccinate synthase  92.62 
 
 		 448 aa  854    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4776  argininosuccinate synthase  96.38 
 
 		 444 aa  881    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3032  argininosuccinate synthase  81.08 
 
 		 446 aa  748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2397  argininosuccinate synthase  66.59 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2046  argininosuccinate synthase  65.29 
 
 		 481 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0297516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8647  argininosuccinate synthase  65.38 
 
 		 488 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.934926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9344  Argininosuccinate synthase  63.24 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4125  argininosuccinate synthase  66.36 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435339  hitchhiker  0.0000508135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0765  argininosuccinate synthase  65.97 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00834768  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2201  argininosuccinate synthase  65.05 
 
 		 482 aa  604  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3484  argininosuccinate synthase  66.13 
 
 		 482 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2474  argininosuccinate synthase  66.04 
 
 		 477 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10110  argininosuccinate synthase  66.04 
 
 		 477 aa  596  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1767  argininosuccinate synthase  63.59 
 
 		 487 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0627257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3085  argininosuccinate synthase  61.89 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0020756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3184  argininosuccinate synthase  61.66 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.182109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3278  argininosuccinate synthase  61.66 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2680  argininosuccinate synthase  61.34 
 
 		 451 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.015666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4163  argininosuccinate synthase  34.64 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  33.17 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  32.93 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  33.33 
 
 		 403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  31.97 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  34.23 
 
 		 403 aa  179  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  32.19 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  33.58 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  32.45 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  34.25 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  33.58 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  33.58 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  32.03 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  31.49 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  32.35 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  31.7 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  31.45 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  31.8 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  31.63 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  30.64 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  32.27 
 
 		 401 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  33.33 
 
 		 399 aa  163  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  32.11 
 
 		 1496 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00700  argininosuccinate synthase, putative  34.32 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>