More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4163 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4163  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 404 aa  836    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 		 408 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  52.12 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  52.62 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 		 414 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  48.99 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  48.99 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  48.6 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 409 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  50.74 
 
 		 412 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  50.5 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  49.01 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  49.63 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  48.42 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  48.99 
 
 		 1496 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  51.5 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  49.25 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  50.39 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  48.88 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  49.25 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  48.4 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  48.52 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  49.36 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  48.51 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00700  argininosuccinate synthase, putative  48.14 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  48.25 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  48.74 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  48.63 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  49.63 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  47.41 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  47.16 
 
 		 402 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  48.37 
 
 		 409 aa  365  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  49.26 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  48.48 
 
 		 409 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  49.24 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  48.47 
 
 		 409 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  48.38 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  47.78 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  47.32 
 
 		 410 aa  362  8e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  47.63 
 
 		 402 aa  362  9e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  46.6 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  48.51 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  47.54 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 		 405 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  47.62 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  48.64 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  47.06 
 
 		 409 aa  359  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  47.04 
 
 		 413 aa  359  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  47.89 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  47.54 
 
 		 413 aa  359  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 		 397 aa  358  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  48.15 
 
 		 408 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  47.32 
 
 		 410 aa  358  9e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  48.02 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  47.38 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  47.24 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  46.94 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  47.52 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  48.49 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  46.91 
 
 		 413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  47.43 
 
 		 409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  48.35 
 
 		 403 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  48.03 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  46.32 
 
 		 407 aa  356  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  45.87 
 
 		 408 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  47.34 
 
 		 403 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  47.9 
 
 		 408 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  46.67 
 
 		 412 aa  355  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  46.98 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  49.35 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  47.9 
 
 		 408 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  47.21 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  46.67 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  46.31 
 
 		 412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  47.25 
 
 		 408 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  46.23 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  47.41 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  47.16 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  47.41 
 
 		 407 aa  352  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  46.42 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  45.89 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  48 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  47.37 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  48.37 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  48.37 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>