More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3766 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03038  argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0534  Argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0912  argininosuccinate synthase  78.64 
 
 		 446 aa  725    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2553  argininosuccinate synthase  84.2 
 
 		 445 aa  770    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3608  argininosuccinate synthase  77.55 
 
 		 448 aa  714    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00639067  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1695  argininosuccinate synthase  78.1 
 
 		 455 aa  715    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0802625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0414  argininosuccinate synthase  76.36 
 
 		 449 aa  709    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3363  argininosuccinate synthase  81.94 
 
 		 446 aa  776    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2233  argininosuccinate synthase  83.45 
 
 		 448 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3585  argininosuccinate synthase  76.64 
 
 		 447 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5242  argininosuccinate synthase  82.99 
 
 		 441 aa  767    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3549  argininosuccinate synthase  76.64 
 
 		 447 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0501  argininosuccinate synthase  81.94 
 
 		 446 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2505  argininosuccinate synthase  78.1 
 
 		 455 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3364  argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142254  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2399  argininosuccinate synthase  82.21 
 
 		 444 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0086  argininosuccinate synthase  77.8 
 
 		 450 aa  715    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0305  argininosuccinate synthase  81.94 
 
 		 446 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5499  argininosuccinate synthase  81.98 
 
 		 444 aa  777    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.619604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3468  argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202724  normal  0.808331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4776  argininosuccinate synthase  85.68 
 
 		 444 aa  773    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5014  argininosuccinate synthase  82.35 
 
 		 445 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0279  argininosuccinate synthase  82.84 
 
 		 446 aa  782    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0397  argininosuccinate synthase  81.04 
 
 		 445 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0090  argininosuccinate synthase  81.26 
 
 		 445 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2423  argininosuccinate synthase  84.55 
 
 		 445 aa  765    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0068  argininosuccinate synthase  77.3 
 
 		 449 aa  709    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2689  argininosuccinate synthase  85.52 
 
 		 447 aa  780    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0031  argininosuccinate synthase  80.14 
 
 		 445 aa  735    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1599  argininosuccinate synthase  90.09 
 
 		 446 aa  833    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0319  argininosuccinate synthase  81.94 
 
 		 446 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.463293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0713  argininosuccinate synthase  80.59 
 
 		 445 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.830506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5926  argininosuccinate synthase  82.99 
 
 		 441 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4430  argininosuccinate synthase  78.36 
 
 		 448 aa  720    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3599  argininosuccinate synthase  77.32 
 
 		 447 aa  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2829  argininosuccinate synthase  84.32 
 
 		 445 aa  764    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.83026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4651  argininosuccinate synthase  82.35 
 
 		 445 aa  774    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3809  argininosuccinate synthase  82.35 
 
 		 445 aa  774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279465  normal  0.39816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1362  argininosuccinate synthase  80.87 
 
 		 444 aa  735    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.814914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4494  argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.976918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3479  argininosuccinate synthase  76.42 
 
 		 447 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3647  argininosuccinate synthase  76.19 
 
 		 447 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02989  hypothetical protein  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5452  argininosuccinate synthase  81.98 
 
 		 445 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3766  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 446 aa  920    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2061  argininosuccinate synthase  81.94 
 
 		 446 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3712  argininosuccinate synthase  82.35 
 
 		 445 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281609  normal  0.0920817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3035  argininosuccinate synthase  86.77 
 
 		 446 aa  804    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2408  argininosuccinate synthase  78.1 
 
 		 455 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3596  argininosuccinate synthase  82.39 
 
 		 445 aa  777    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2224  argininosuccinate synthase  81.94 
 
 		 446 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4149  argininosuccinate synthase  78.36 
 
 		 448 aa  719    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0238  argininosuccinate synthase  79.01 
 
 		 445 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3480  argininosuccinate synthase  76.42 
 
 		 447 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0527  argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000123747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1856  argininosuccinate synthase  85.91 
 
 		 447 aa  783    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1082  argininosuccinate synthase  90.3 
 
 		 445 aa  815    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2743  argininosuccinate synthase  83.45 
 
 		 448 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3657  argininosuccinate synthase  77.1 
 
 		 447 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0900024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3032  argininosuccinate synthase  81.94 
 
 		 446 aa  776    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3461  argininosuccinate synthase  83.52 
 
 		 453 aa  760    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8647  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 488 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.934926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4125  argininosuccinate synthase  67.11 
 
 		 475 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435339  hitchhiker  0.0000508135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1767  argininosuccinate synthase  67.37 
 
 		 487 aa  618  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0627257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2046  argininosuccinate synthase  66.13 
 
 		 481 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0297516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0765  argininosuccinate synthase  66.28 
 
 		 470 aa  607  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00834768  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2397  argininosuccinate synthase  66.74 
 
 		 473 aa  604  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9344  Argininosuccinate synthase  64.55 
 
 		 482 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2201  argininosuccinate synthase  64.77 
 
 		 482 aa  599  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10110  argininosuccinate synthase  63.66 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3484  argininosuccinate synthase  64.07 
 
 		 482 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2474  argininosuccinate synthase  66.43 
 
 		 477 aa  591  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3278  argininosuccinate synthase  61.05 
 
 		 450 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3085  argininosuccinate synthase  61.28 
 
 		 450 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0020756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3184  argininosuccinate synthase  61.05 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.182109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2680  argininosuccinate synthase  61.28 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.015666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  33.74 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  32.84 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4163  argininosuccinate synthase  32.51 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  30.27 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  32.65 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  31.41 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  31.6 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  30.7 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  30.1 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  32.2 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  30.62 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  32.14 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  32.69 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  32.08 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  33.15 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  32.42 
 
 		 1496 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  31.03 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  32.75 
 
 		 409 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  31.94 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0690  argininosuccinate synthase  31.07 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  32.55 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  32.37 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  33.16 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34492  argininosuccinate synthetase  31.19 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.491384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>