More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1335 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  100 
 
 
399 aa  811    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  70.93 
 
 
402 aa  610  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  57.32 
 
 
413 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  55.92 
 
 
401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  56.06 
 
 
406 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  53.77 
 
 
401 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  53.77 
 
 
401 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  54.27 
 
 
401 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  53.77 
 
 
401 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  53.27 
 
 
401 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  53.52 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  53.27 
 
 
401 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  53.27 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  53.52 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  55.05 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  53.27 
 
 
401 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  52.14 
 
 
400 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  54.64 
 
 
399 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  53.27 
 
 
401 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  52.39 
 
 
400 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  53.27 
 
 
401 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  52.51 
 
 
399 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  54.18 
 
 
409 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 
399 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  53.05 
 
 
401 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 
396 aa  428  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  55.47 
 
 
410 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
400 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  54.16 
 
 
1496 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  53.77 
 
 
397 aa  428  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  53 
 
 
464 aa  425  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  52.03 
 
 
400 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  54.02 
 
 
410 aa  425  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 
402 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  53.16 
 
 
404 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  52.63 
 
 
408 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  53.15 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  52.5 
 
 
408 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
401 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  52.76 
 
 
400 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  51.78 
 
 
401 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  53.44 
 
 
400 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  51.78 
 
 
401 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  52.02 
 
 
404 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  53.15 
 
 
401 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  52.14 
 
 
399 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  52.51 
 
 
400 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 
397 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 
420 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
407 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  49.12 
 
 
406 aa  408  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  52.66 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 
402 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  52.41 
 
 
401 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  51.64 
 
 
399 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 
397 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
397 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  51.64 
 
 
399 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 
403 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
403 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
407 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  48.99 
 
 
406 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
403 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  48.74 
 
 
406 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  50 
 
 
403 aa  391  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
400 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  48.48 
 
 
406 aa  391  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  51.4 
 
 
410 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
396 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
401 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  48.85 
 
 
397 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
403 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  49.48 
 
 
399 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
419 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  47.96 
 
 
406 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  50.62 
 
 
406 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  48.39 
 
 
402 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  48.35 
 
 
403 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  48.21 
 
 
406 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  48.21 
 
 
406 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  48.38 
 
 
399 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
400 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  47.97 
 
 
406 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 
405 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  48.72 
 
 
406 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  49 
 
 
409 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  48.99 
 
 
406 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 
400 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  50.37 
 
 
419 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  48.63 
 
 
399 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
404 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  48.48 
 
 
401 aa  378  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  47.96 
 
 
408 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  47.7 
 
 
405 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
416 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  48.99 
 
 
411 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>