More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3484 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8647  argininosuccinate synthase  80.33 
 
 		 488 aa  797    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.934926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4125  argininosuccinate synthase  72.95 
 
 		 475 aa  714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435339  hitchhiker  0.0000508135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10110  argininosuccinate synthase  76.91 
 
 		 477 aa  749    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1767  argininosuccinate synthase  82.44 
 
 		 487 aa  818    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0627257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2046  argininosuccinate synthase  84.65 
 
 		 481 aa  837    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0297516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3484  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 482 aa  979    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2201  argininosuccinate synthase  88.38 
 
 		 482 aa  874    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0765  argininosuccinate synthase  83.82 
 
 		 470 aa  816    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00834768  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2474  argininosuccinate synthase  74.59 
 
 		 477 aa  739    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9344  Argininosuccinate synthase  88.38 
 
 		 482 aa  878    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2397  argininosuccinate synthase  72.31 
 
 		 473 aa  716    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5242  argininosuccinate synthase  67.51 
 
 		 441 aa  631  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166479  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5926  argininosuccinate synthase  68.53 
 
 		 441 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0912  argininosuccinate synthase  68.12 
 
 		 446 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1362  argininosuccinate synthase  68.46 
 
 		 444 aa  626  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.814914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03038  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  618  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0534  Argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3468  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202724  normal  0.808331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3599  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4494  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.976918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3657  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0900024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02989  hypothetical protein  65.9 
 
 		 447 aa  618  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0527  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  618  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000123747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3364  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 447 aa  618  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142254  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5499  argininosuccinate synthase  67.28 
 
 		 444 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.619604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0086  argininosuccinate synthase  66.97 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0068  argininosuccinate synthase  65.32 
 
 		 449 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4149  argininosuccinate synthase  66.36 
 
 		 448 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3479  argininosuccinate synthase  65.45 
 
 		 447 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3608  argininosuccinate synthase  66.2 
 
 		 448 aa  614  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00639067  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4430  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 448 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3549  argininosuccinate synthase  65.68 
 
 		 447 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3585  argininosuccinate synthase  65.68 
 
 		 447 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3480  argininosuccinate synthase  65.45 
 
 		 447 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3647  argininosuccinate synthase  65.45 
 
 		 447 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1599  argininosuccinate synthase  65.37 
 
 		 446 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2553  argininosuccinate synthase  66.13 
 
 		 445 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3363  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0305  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2061  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0501  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2423  argininosuccinate synthase  64.93 
 
 		 445 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0397  argininosuccinate synthase  65.45 
 
 		 445 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0279  argininosuccinate synthase  64.8 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0713  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 445 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.830506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0319  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.463293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2829  argininosuccinate synthase  65.16 
 
 		 445 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.83026 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3032  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2224  argininosuccinate synthase  65.02 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712669  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3035  argininosuccinate synthase  66.9 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2408  argininosuccinate synthase  64.07 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2505  argininosuccinate synthase  64.07 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2233  argininosuccinate synthase  65.97 
 
 		 448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1695  argininosuccinate synthase  64.07 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0802625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0238  argininosuccinate synthase  65.45 
 
 		 445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4776  argininosuccinate synthase  64.76 
 
 		 444 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1082  argininosuccinate synthase  65.97 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2743  argininosuccinate synthase  65.97 
 
 		 448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0090  argininosuccinate synthase  65.68 
 
 		 445 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0031  argininosuccinate synthase  65.45 
 
 		 445 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0414  argininosuccinate synthase  67.59 
 
 		 449 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2399  argininosuccinate synthase  66.2 
 
 		 444 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3596  argininosuccinate synthase  66.2 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4651  argininosuccinate synthase  66.2 
 
 		 445 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3809  argininosuccinate synthase  66.2 
 
 		 445 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279465  normal  0.39816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5452  argininosuccinate synthase  65.97 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3712  argininosuccinate synthase  66.2 
 
 		 445 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281609  normal  0.0920817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5014  argininosuccinate synthase  65.97 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3766  argininosuccinate synthase  64.07 
 
 		 446 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1856  argininosuccinate synthase  64.57 
 
 		 447 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3461  argininosuccinate synthase  66.2 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2689  argininosuccinate synthase  64.25 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2680  argininosuccinate synthase  62.71 
 
 		 451 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.015666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3085  argininosuccinate synthase  63.4 
 
 		 450 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0020756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3278  argininosuccinate synthase  63.64 
 
 		 450 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3184  argininosuccinate synthase  63.4 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.182109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  34.29 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  32.77 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  31.04 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  33.94 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  32.74 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  33.08 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4163  argininosuccinate synthase  32.96 
 
 		 404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0487  argininosuccinate synthase  31 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00571423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  32.6 
 
 		 403 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  33.42 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  31.02 
 
 		 401 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  33.98 
 
 		 410 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  32.64 
 
 		 399 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  33.98 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34492  argininosuccinate synthetase  31.49 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.491384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  30.36 
 
 		 403 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  33.7 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  30.15 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  30.15 
 
 		 409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  32.79 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  32.52 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  34.1 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  33.98 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  36.44 
 
 		 409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>