More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0690 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0690  argininosuccinate synthase  100 
 
 
408 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  52.63 
 
 
406 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  52.63 
 
 
406 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  52.63 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  51.63 
 
 
406 aa  442  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 
403 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  52.04 
 
 
419 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  54.08 
 
 
403 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 
413 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 
406 aa  432  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  51.91 
 
 
406 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 
407 aa  433  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  52.24 
 
 
413 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  51.91 
 
 
412 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  49.36 
 
 
409 aa  428  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 
413 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 
409 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 
413 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  52.76 
 
 
409 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
410 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  50 
 
 
404 aa  429  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
407 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  50.37 
 
 
409 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  53.18 
 
 
413 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  51.63 
 
 
410 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  53.33 
 
 
401 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  49.39 
 
 
411 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  52.44 
 
 
403 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
407 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
407 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  50.89 
 
 
409 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  51.76 
 
 
402 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  52.31 
 
 
404 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
419 aa  426  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  51.15 
 
 
416 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 
408 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  51.53 
 
 
409 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  51.9 
 
 
468 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  52.55 
 
 
405 aa  421  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  50.75 
 
 
404 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  51.63 
 
 
408 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  51.4 
 
 
409 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  52.16 
 
 
405 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 
407 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  52.82 
 
 
407 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  51.29 
 
 
405 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 
407 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  49.36 
 
 
402 aa  418  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  50.74 
 
 
407 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 
406 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  51.7 
 
 
410 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
408 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  49.36 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
409 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
409 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  51.41 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  50.89 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  51.14 
 
 
410 aa  418  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  49.1 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  51.66 
 
 
409 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  48.99 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  49.1 
 
 
405 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
412 aa  413  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  52.56 
 
 
399 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
405 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
408 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  51.42 
 
 
397 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 
410 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  49.61 
 
 
402 aa  413  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
408 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
412 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  52.56 
 
 
399 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  48.87 
 
 
405 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  49.12 
 
 
405 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  48.87 
 
 
405 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  49.12 
 
 
405 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 
408 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  50.9 
 
 
397 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  51.3 
 
 
404 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  49.12 
 
 
405 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  49.12 
 
 
405 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  48.85 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  49.48 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  48.87 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  50.9 
 
 
414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  48.61 
 
 
405 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  48.61 
 
 
405 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  48.25 
 
 
406 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  48.97 
 
 
406 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  48.72 
 
 
408 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0367  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  47.97 
 
 
408 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 
408 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>