More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2043 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  58.05 
 
 		 683 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2043  small GTP-binding protein  100 
 
 		 687 aa  1345    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.713225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  55.06 
 
 		 687 aa  658    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.39 
 
 		 695 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  37.28 
 
 		 696 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.92 
 
 		 683 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.35 
 
 		 691 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.57 
 
 		 692 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  36.43 
 
 		 679 aa  439  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  36.28 
 
 		 694 aa  436  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.57 
 
 		 686 aa  431  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  38.56 
 
 		 680 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  37.97 
 
 		 683 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  37.76 
 
 		 686 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  38.67 
 
 		 688 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  36.66 
 
 		 693 aa  420  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  34.95 
 
 		 695 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  35.68 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  35.98 
 
 		 692 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  38 
 
 		 690 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  35.18 
 
 		 703 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  35.83 
 
 		 692 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  36.04 
 
 		 694 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  36.21 
 
 		 692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  38.48 
 
 		 688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  34.55 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  35.13 
 
 		 694 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  35.89 
 
 		 692 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  32.69 
 
 		 696 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  38.36 
 
 		 708 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  34.08 
 
 		 701 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  35.13 
 
 		 692 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  33.78 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  34.58 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  36.16 
 
 		 673 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  34.53 
 
 		 701 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  38.45 
 
 		 701 aa  399  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  33.93 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  35.59 
 
 		 681 aa  394  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  36.89 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  32.74 
 
 		 696 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  32.7 
 
 		 688 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.72 
 
 		 687 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  37.24 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  37.66 
 
 		 719 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  35.26 
 
 		 694 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.8 
 
 		 701 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  33.13 
 
 		 696 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  38.15 
 
 		 719 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  34.11 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  32.99 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  33.82 
 
 		 699 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  34.99 
 
 		 692 aa  389  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  33.72 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  32.89 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  34.23 
 
 		 697 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.35 
 
 		 701 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  32.85 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  32.88 
 
 		 697 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  32.75 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  33.78 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  36.51 
 
 		 687 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.97 
 
 		 697 aa  382  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  33.63 
 
 		 692 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  35.67 
 
 		 685 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  33.33 
 
 		 692 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  35.07 
 
 		 696 aa  382  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.82 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  34.16 
 
 		 689 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  33.92 
 
 		 697 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  33.57 
 
 		 701 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  34.33 
 
 		 691 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  33.53 
 
 		 699 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  33.53 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  33.18 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  35.37 
 
 		 694 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  34.2 
 
 		 702 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  33.93 
 
 		 696 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.77 
 
 		 683 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  35.02 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  34.59 
 
 		 689 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  34.07 
 
 		 694 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  34.07 
 
 		 694 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  34.11 
 
 		 701 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  34.75 
 
 		 689 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  33.97 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.21 
 
 		 670 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  35.12 
 
 		 706 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  34.15 
 
 		 698 aa  375  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  33.53 
 
 		 685 aa  375  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  33.73 
 
 		 686 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  32.56 
 
 		 703 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  34.55 
 
 		 692 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  34.55 
 
 		 692 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.14 
 
 		 691 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  35.53 
 
 		 690 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  34.12 
 
 		 692 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  34.28 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  32.69 
 
 		 692 aa  372  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  33.09 
 
 		 700 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>