79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1657 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1657    100 
 
 
755 bp  1497    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625202  normal  0.215657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3879  XRE family transcriptional regulator  84.48 
 
 
744 bp  349  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.478998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3152  helix-turn-helix domain protein  83.84 
 
 
744 bp  325  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.769189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  98.18 
 
 
1011 bp  295  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  97.58 
 
 
294 bp  295  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3387    98.17 
 
 
309 bp  293  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0582875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3831  hypothetical protein  100 
 
 
315 bp  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  98.7 
 
 
240 bp  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  97.59 
 
 
9828 bp  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  98.7 
 
 
294 bp  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  97.59 
 
 
522 bp  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  98.7 
 
 
450 bp  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  97.59 
 
 
1545 bp  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  97.58 
 
 
519 bp  287  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  97.58 
 
 
1569 bp  287  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  97.58 
 
 
303 bp  287  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  97.56 
 
 
339 bp  285  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0375    97.48 
 
 
159 bp  283  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.851107  normal  0.316386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  98.05 
 
 
330 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  96.99 
 
 
1545 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  96.99 
 
 
6603 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  98.05 
 
 
297 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2103    97.53 
 
 
282 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  98.05 
 
 
471 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  96.99 
 
 
432 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  98.05 
 
 
399 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  96.99 
 
 
915 bp  281  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  98.04 
 
 
408 bp  280  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  96.41 
 
 
366 bp  276  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0341  hypothetical protein  98.64 
 
 
315 bp  276  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  96.36 
 
 
315 bp  272  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  96.36 
 
 
519 bp  272  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  97.39 
 
 
318 bp  272  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  95.83 
 
 
1185 bp  270  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  96.34 
 
 
504 bp  270  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2316    96.34 
 
 
1061 bp  270  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000290431  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3629  hypothetical protein  97.96 
 
 
303 bp  268  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1527  hypothetical protein  97.96 
 
 
285 bp  268  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124431  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  96.75 
 
 
309 bp  266  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4499  XRE family transcriptional regulator  82.58 
 
 
732 bp  266  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  96.75 
 
 
267 bp  266  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  95.78 
 
 
1749 bp  266  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  95.76 
 
 
834 bp  264  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  96.15 
 
 
288 bp  262  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0425  hypothetical protein  96.75 
 
 
240 bp  258  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  95.15 
 
 
318 bp  256  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  95.15 
 
 
1158 bp  256  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1891  hypothetical protein  96.1 
 
 
240 bp  250  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286259  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  95.03 
 
 
918 bp  248  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2214  hypothetical protein  96.58 
 
 
243 bp  242  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  95.89 
 
 
630 bp  226  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0535  XRE family transcriptional regulator  84.59 
 
 
741 bp  222  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  95.24 
 
 
378 bp  220  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  93.88 
 
 
579 bp  212  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  94.52 
 
 
1692 bp  210  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0307  helix-turn-helix domain-containing protein  80.61 
 
 
732 bp  204  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2169  hypothetical protein  97.94 
 
 
246 bp  168  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.91364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  95.33 
 
 
336 bp  165  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1122    87.43 
 
 
168 bp  165  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  96.94 
 
 
471 bp  163  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0454  XRE family transcriptional regulator  80.11 
 
 
732 bp  151  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.154754  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  94.79 
 
 
300 bp  143  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5081  helix-turn-helix domain protein  79.61 
 
 
735 bp  139  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  100 
 
 
288 bp  135  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  100 
 
 
429 bp  133  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
1734 bp  127  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4257  hypothetical protein  100 
 
 
243 bp  123  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.751318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4444  hypothetical protein  96.77 
 
 
282 bp  107  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0580    96.72 
 
 
306 bp  105  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2836  hypothetical protein  96.72 
 
 
387 bp  105  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  100 
 
 
423 bp  93.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3510  hypothetical protein  97.87 
 
 
291 bp  85.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0575334  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  97.83 
 
 
975 bp  83.8  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4860  histidine biosynthesis  97.83 
 
 
690 bp  83.8  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155368  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  97.83 
 
 
573 bp  83.8  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3216  hypothetical protein  97.83 
 
 
684 bp  83.8  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0618648  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  97.73 
 
 
1434 bp  79.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4769  fatty acid desaturase  95.65 
 
 
918 bp  75.8  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.237988  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3062  helix-turn-helix domain-containing protein  92.31 
 
 
738 bp  54  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>