27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0535 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0535  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3152  helix-turn-helix domain protein  81.89 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.769189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3879  XRE family transcriptional regulator  81.89 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.478998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4499  XRE family transcriptional regulator  81.48 
 
 		 243 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0454  XRE family transcriptional regulator  78.6 
 
 		 243 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.154754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0307  helix-turn-helix domain-containing protein  76.54 
 
 		 243 aa  387  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5081  helix-turn-helix domain protein  75 
 
 		 244 aa  380  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3062  helix-turn-helix domain-containing protein  64.61 
 
 		 245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4174  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.383217  normal  0.0580718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4193  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177463  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3343  helix-turn-helix domain-containing protein  41.98 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3581  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.367106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4061  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.859423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1857  XRE family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1901  XRE family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05315  hypothetical protein  36.89 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000569  predicted transcriptional regulator  35.25 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01350  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3109  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3530  hypothetical protein  34.87 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2371  XRE family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000292572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3619  XRE family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00769  protein containing HTH domain  29.22 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3283  helix-turn-helix domain-containing protein  23.61 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1482  XRE family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06896  hypothetical protein  23.02 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000898  hypothetical protein  23.74 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>