72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2367 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  100 
 
 		 94 aa  187  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  64.94 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  63.64 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  54.55 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  56.58 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  47.95 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  38.37 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  38.82 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  38.82 
 
 		 89 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  37.65 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  38.75 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  43.42 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  39.29 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  45.45 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  36.9 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  39.47 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  37.04 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1496  NapD  46.75 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0665869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  37.04 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49230  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  38.55 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085279  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4204  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  38.55 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  40.79 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2175  nitrate reductase accessory periplasmic protein NapD  40.24 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.791582  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  34.52 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  40.79 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  40 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  41.25 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  44.16 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1020  NapD family protein  35.14 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  40.26 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  43.42 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  43.42 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  40.51 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5179  NapD family protein  37.04 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  41.89 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  42.11 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1509  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  31.08 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  41.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  41.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  35.62 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  32.91 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  35.29 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  36.59 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3487  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.53 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  28.57 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3516  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  32.43 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.107593  hitchhiker  0.00119536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2410  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.37 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  32.26 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  32.26 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2792  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  33.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.153491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1386  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  33.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.692667  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  26.19 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1272  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  33.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.714743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  30.34 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3166  periplasmic nitrate reductase NapD  28 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1592  NapD family protein  29.41 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1452  NapD family protein  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02134  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02093  hypothetical protein  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3344  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0668522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0734  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2345  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2506  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1443  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2500  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  28.77 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000853454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2939  NapD family protein  28.38 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1058  napD protein  37.66 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2355  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  29.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4720  NapD family protein  31.08 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0174846  normal  0.0205455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  29.17 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1621  NapD  35.71 
 
 		 67 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.237828  normal  0.0835326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0083  hypothetical protein  32 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>