64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2175 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2175  nitrate reductase accessory periplasmic protein NapD  100 
 
 		 86 aa  170  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.791582  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  47.62 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  45.24 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  44.05 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  43.37 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  46.43 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  43.37 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  42.17 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  47.44 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  44.05 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  51.85 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  52.5 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  50.62 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  40.48 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  41.03 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  38.75 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  44.44 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  39.51 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  43.21 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  43.21 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  43.21 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  41.98 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4204  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  43.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49230  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  43.42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085279  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  43.42 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  40.74 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  39.51 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  40.74 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  43.42 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  43.42 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  40.74 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1496  NapD  40.74 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0665869  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  41.98 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1020  NapD family protein  39.19 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  37.66 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  38.75 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  34.57 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  35.71 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  35.71 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2355  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2506  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1452  NapD family protein  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02093  hypothetical protein  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3344  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0668522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0734  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1443  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2345  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02134  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  36.49 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3487  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.37 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1386  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.4 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.692667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1272  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.4 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2792  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.4 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.153491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  37.84 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2500  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.5 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000853454 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1509  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  28 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.58 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1621  NapD  44.64 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.237828  normal  0.0835326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  32.88 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  29.76 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2410  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.26 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3166  periplasmic nitrate reductase NapD  31.17 
 
 		 100 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>