69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3205 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  100 
 
 		 89 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  73.86 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  71.26 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  75.9 
 
 		 84 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  72.41 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  70.11 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  70.11 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  69.89 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  70.11 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  75.9 
 
 		 83 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  69.89 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  68.82 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  65.43 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  45.35 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  45.35 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  45.35 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  45.35 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  44.19 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  44.58 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  45.45 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  42.17 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  44.05 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  46.43 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  44.16 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  44.16 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1496  NapD  42.17 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0665869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  42.17 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  42.17 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2175  nitrate reductase accessory periplasmic protein NapD  40.48 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.791582  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  35.71 
 
 		 114 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  35.71 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  36.47 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  38.37 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  38.46 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1020  NapD family protein  40 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  34.94 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3487  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  37.18 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1058  napD protein  44.16 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  34.12 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3166  periplasmic nitrate reductase NapD  33.73 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2355  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.16 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3344  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0668522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1443  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0734  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02093  hypothetical protein  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1452  NapD family protein  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2345  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02134  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2506  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35.16 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4204  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  32.05 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2410  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  37.5 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49230  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  32.05 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085279  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1621  NapD  44.62 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.237828  normal  0.0835326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4720  NapD family protein  33.73 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0174846  normal  0.0205455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  35 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2500  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  34.07 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000853454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2792  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.95 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.153491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1272  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.95 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1386  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.95 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.692667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  32.89 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  32.88 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  29.76 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  29.63 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1509  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  26.67 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1592  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  30.14 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3516  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  26.83 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.107593  hitchhiker  0.00119536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>