64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1902 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  100 
 
 		 85 aa  169  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  89.41 
 
 		 85 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  89.41 
 
 		 85 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  88.24 
 
 		 85 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  87.06 
 
 		 85 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  89.61 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  89.61 
 
 		 85 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  89.61 
 
 		 85 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  74.12 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  72.62 
 
 		 85 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  71.76 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1496  NapD  67.86 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0665869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  69.41 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1621  NapD  70.15 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.237828  normal  0.0835326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  44.19 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  44.58 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  46.51 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  45.35 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  46.51 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  42.86 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  46.51 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  42.17 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  41.86 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  43.37 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  48.24 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  45.35 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  43.37 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  40.96 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  47.06 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  44.3 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  48.05 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2175  nitrate reductase accessory periplasmic protein NapD  40.74 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.791582  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  41.03 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  39.76 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  41.56 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1509  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  34.62 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3487  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.14 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1272  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.76 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2792  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.76 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.153491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1386  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  31.76 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.692667  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2500  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  34.48 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000853454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2410  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  39.74 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  32.05 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02093  hypothetical protein  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1452  NapD family protein  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3344  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0668522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  37.18 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0734  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02134  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2355  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1443  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2506  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2345  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  39.06 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49230  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  29.87 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085279  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4204  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  29.87 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2939  NapD family protein  31.51 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  32.47 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  32.47 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1592  NapD family protein  35.21 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  30.77 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  30.67 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5179  NapD family protein  29.63 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  35.71 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>