27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2939 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2939  NapD family protein  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5179  NapD family protein  61.9 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4720  NapD family protein  40 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0174846  normal  0.0205455 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  37.33 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  36.99 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  37.8 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  33.78 
 
 		 85 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  34.67 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  31.51 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  31.51 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  31.51 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  32 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1741  NapD family protein  35.14 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295398  normal  0.0137625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  30.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  31.51 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  30.67 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  31.88 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  30.67 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  29.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  31.88 
 
 		 85 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  31.88 
 
 		 85 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  30.67 
 
 		 112 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  29.33 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  28.77 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07610  hypothetical protein  34.21 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.613886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  24 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  29.11 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>