33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5179 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5179  NapD family protein  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2939  NapD family protein  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4720  NapD family protein  39.47 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0174846  normal  0.0205455 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  39.51 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  37.8 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  39.53 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  35.21 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3487  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.1 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  34.25 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  34.67 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  30.77 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  34.25 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  34.25 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  27.85 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  29.49 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  29.49 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  29.49 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  32.05 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  29.49 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  27.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  29.63 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  32.88 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  30.95 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  30.59 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  29.33 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  29.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  29.27 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.49 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  31.17 
 
 		 85 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  27.27 
 
 		 89 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>