42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4115 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4115  NapD  100 
 
 		 88 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  77.27 
 
 		 88 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4720  NapD family protein  40.28 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0174846  normal  0.0205455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  37.04 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  33.33 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5179  NapD family protein  39.51 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2939  NapD family protein  36.99 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  34.94 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  33.33 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  35.62 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  35.9 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  35.9 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  35.9 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  35.9 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  32.05 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  32.05 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  34.25 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  34.25 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  29.55 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  32.05 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  29.55 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  29.76 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  34.52 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  39.29 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  32.91 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  32.91 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  31.58 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  32.91 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1592  NapD family protein  32.35 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  29.63 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  30.95 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  29.76 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1155  NapD  27.14 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.23731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  27.12 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  35.71 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  30.26 
 
 		 91 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  30.26 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  29.49 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  35.62 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  25.64 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>