63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3487 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3487  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  100 
 
 		 88 aa  179  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1386  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  67.05 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.692667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2792  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  67.05 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.153491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1272  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  67.05 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2355  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  50.57 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3344  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0668522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1443  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0734  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02134  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2345  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2506  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1509  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  53.09 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1452  NapD family protein  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02093  hypothetical protein  50.57 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2500  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  49.43 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000853454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  40.96 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2410  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  40 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  37.18 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  35.29 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  35.44 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  37.18 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  35.44 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  37.18 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  35.63 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  37.18 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  36.59 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  35 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  37.18 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  33.75 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  35.9 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  35.9 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  33.72 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  37.18 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  37.18 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  35.9 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  35 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  33.72 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  32.5 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  32.5 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  32.5 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  33.33 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  34.62 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1020  NapD family protein  34.67 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49230  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  34.62 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085279  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4204  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  34.62 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170838  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1496  NapD  34.48 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0665869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  32.14 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5179  NapD family protein  32.1 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2175  nitrate reductase accessory periplasmic protein NapD  35.37 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.791582  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  33.33 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  33.33 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  31.25 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  36.59 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  33.75 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  39.02 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  37.18 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  35.63 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  32.91 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  35.53 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  31.17 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  35.21 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  28.57 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3166  periplasmic nitrate reductase NapD  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>