51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1592 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1592  NapD family protein  100 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3516  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  40.85 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.107593  hitchhiker  0.00119536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  36.25 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  36.11 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  36.62 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  33.78 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  33.33 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  33.33 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  33.75 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  35 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  38.89 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  33.75 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  33.75 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  31.25 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  31.25 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1509  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  34.78 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  33.77 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  41.43 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  31.88 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  32.35 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  34.57 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  33.78 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  31.94 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  37.84 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  31.17 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  38.57 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  38.57 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1272  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  34.29 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.714743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1058  napD protein  37.5 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2792  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  34.29 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.153491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1386  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  34.29 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.692667  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  32.35 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  35.14 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  35.14 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  35.14 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  35.14 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2500  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000853454 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  27.42 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  33.33 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1344  hypothetical protein  32.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.933529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  35.21 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0734  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1443  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2506  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2345  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3344  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0668522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4720  NapD family protein  29.11 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0174846  normal  0.0205455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1452  NapD family protein  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02093  hypothetical protein  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02134  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2410  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  32.43 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>