39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1621 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1621  NapD  100 
 
 		 67 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.237828  normal  0.0835326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  74.63 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  71.64 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  70.15 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  70.15 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  70.15 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  70.15 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  68.66 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  72.88 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  72.88 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  68.66 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  72.88 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1496  NapD  69.7 
 
 		 85 aa  87.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0665869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  65.15 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  44.12 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  45.45 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  58.33 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  49.25 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  50 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  49.25 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  49.25 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  58.33 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  45.59 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  46.15 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  44.62 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  41.54 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  43.08 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  40.68 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  46.88 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  47.46 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1912  NapD protein  48.28 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000235521  normal  0.427921 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  44.93 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2175  nitrate reductase accessory periplasmic protein NapD  44.64 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.791582  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0616  napD protein  48.89 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  36.23 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  35.71 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2410  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  37.68 
 
 		 106 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1058  napD protein  36.92 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  47.92 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>