24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2447 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  847    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  39.83 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  33.9 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  32.18 
 
 		 365 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  35.29 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  31.02 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  30.99 
 
 		 390 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  30.65 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  30.35 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  30.17 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  28.07 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  30.64 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  31.59 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  28.8 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  24.42 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  25.39 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  24.08 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  25.43 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  22.66 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  20.75 
 
 		 354 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  23.8 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  24.5 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  24.41 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  20.67 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>