21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1614 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  865    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  56.88 
 
 
423 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  52.17 
 
 
450 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  51.32 
 
 
413 aa  401  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  25.28 
 
 
355 aa  122  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  25.99 
 
 
383 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  23.59 
 
 
354 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  22.93 
 
 
342 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  21.75 
 
 
398 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  20.48 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  25.69 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  24.35 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  23.23 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  21.35 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  23.68 
 
 
364 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  23.3 
 
 
365 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  21.64 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  21.03 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  21.81 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  23.37 
 
 
371 aa  47  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>