25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0400 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  37.11 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  36.29 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  32.11 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  34.12 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  35.34 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  28.07 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  26.86 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  26.87 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  27.3 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  26.61 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  24.72 
 
 		 365 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  23.75 
 
 		 381 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  24.73 
 
 		 390 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  23.91 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  24.55 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  26 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  24.85 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  23.29 
 
 		 435 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  22.19 
 
 		 412 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  21.58 
 
 		 450 aa  95.9  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  23.65 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  22.93 
 
 		 412 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  23.55 
 
 		 413 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1032  hypothetical protein  25.69 
 
 		 404 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.435102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>