25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2484 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  728    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  33.14 
 
 		 342 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  32.71 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  33.15 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  32.77 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  30.48 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  26.76 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  26.15 
 
 		 365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  25.89 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  26.9 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  25.84 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  26.23 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  26.35 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  25.75 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  24.4 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  26.78 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  27.2 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  29.44 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  26.78 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  24.73 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  23.97 
 
 		 413 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  24.93 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  24.33 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  22.38 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0473  hypothetical protein  23.1 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>