27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2260 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  90.52 
 
 		 365 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  99.18 
 
 		 365 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  59.89 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  55.4 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  56.22 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  58.7 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  45.4 
 
 		 370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  39.83 
 
 		 373 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  39.49 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  42.01 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  37.54 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  34.99 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  26.86 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  29.14 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  28.73 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  24.37 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  26.25 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  25.62 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  26.45 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  26.11 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  25.41 
 
 		 450 aa  69.3  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  21.94 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  23.23 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1032  hypothetical protein  26.64 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.435102  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0473  hypothetical protein  23.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2818  hypothetical protein  24.91 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.425711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>