27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1818 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  760    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  62.09 
 
 		 375 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  60.94 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  59.89 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  60.11 
 
 		 365 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  60.81 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  51.61 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  42.18 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  40.33 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  36.97 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  39.36 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  40.36 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  30.73 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  31.38 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  30.06 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  24.72 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  25.35 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  26.26 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  28.48 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  24.66 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  25.79 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1032  hypothetical protein  24.06 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.435102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  21.34 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  25.07 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2027  hypothetical protein  25.68 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000044549 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1033  hypothetical protein  22.85 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.690507  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0929  hypothetical protein  27.4 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0104802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>