25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3076 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  100 
 
 
353 aa  743    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  54.16 
 
 
398 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  37.11 
 
 
342 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  32.93 
 
 
355 aa  206  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  29.63 
 
 
383 aa  202  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  31.36 
 
 
354 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  28.61 
 
 
381 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  27.99 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  30.06 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  28.89 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  28.73 
 
 
365 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  27.68 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  28.32 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  26.65 
 
 
435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  24.52 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  25.15 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  25.07 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  24.7 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  25.43 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  23.44 
 
 
450 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  23.42 
 
 
413 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  22.49 
 
 
395 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  21.55 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  20.48 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0474  hypothetical protein  32.08 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>