23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0765 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  43.85 
 
 		 370 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  39.83 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  41.16 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  40.7 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  38.76 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  38.38 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  37.83 
 
 		 371 aa  266  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  41.54 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  37.25 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  38.03 
 
 		 381 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  32.85 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  31.75 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  29.77 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  27.13 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  27.07 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  26.82 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  25.82 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  26.17 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  23.31 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  26.29 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  22.74 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  24 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>