24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0870 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  864    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  55.83 
 
 
412 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  50.13 
 
 
450 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  49.73 
 
 
413 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  28.34 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  27.56 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  23.53 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  26.01 
 
 
381 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  21.82 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  27.25 
 
 
395 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  21.18 
 
 
353 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  26.84 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  26.08 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  26.08 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  24 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  26.39 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  25.13 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  20.27 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  26.34 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  25.54 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  24.09 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  24.73 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  22.29 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  23.23 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>