25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2672 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  780    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  62.09 
 
 
365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  57.39 
 
 
371 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  55.4 
 
 
365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  55.81 
 
 
365 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  56.57 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  48.14 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  40.11 
 
 
370 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  38.22 
 
 
373 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  37.85 
 
 
381 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  41.02 
 
 
364 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  36.1 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  31.68 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  27.09 
 
 
412 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  27.3 
 
 
342 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  27.68 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  26.18 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  24.53 
 
 
398 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  25.36 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  24.72 
 
 
354 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  25.68 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  22.58 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  20.16 
 
 
450 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  21.64 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1032  hypothetical protein  25.28 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.435102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>