24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1382 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  776    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  45.4 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  46 
 
 
365 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  46.24 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  42.18 
 
 
365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  40.11 
 
 
375 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  42.9 
 
 
373 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  42.47 
 
 
435 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  41.93 
 
 
381 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  42.42 
 
 
371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  37.57 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  40.3 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  39.54 
 
 
395 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  29.71 
 
 
412 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  28.07 
 
 
342 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  27.99 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  25.85 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  23.27 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  22.19 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  24.2 
 
 
354 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  25.27 
 
 
450 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  24.03 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  24 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.774853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>