23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2107 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  935    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  52.17 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  51.72 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  50.66 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  26.5 
 
 		 383 aa  127  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  27 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  23.92 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  25.27 
 
 		 370 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  21.58 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  23.44 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  26.19 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  21.49 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  24.59 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  23.16 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  25.41 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  23.62 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  25.41 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  22.56 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  21.34 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  20.16 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  22.69 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  24.06 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  22.44 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>