134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0634 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0634  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
408 aa  803    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0779825  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  70.59 
 
 
403 aa  586  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313576  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0674  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  67.67 
 
 
419 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143074  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0540  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  56.04 
 
 
413 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0929  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.46 
 
 
376 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1482  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.81 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1726  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.84 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.78327  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.05 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.05 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.79 
 
 
623 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.35 
 
 
596 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.79 
 
 
619 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.79 
 
 
619 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.79 
 
 
619 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.79 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  35.78 
 
 
691 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5137  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.52 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140315  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.73 
 
 
622 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.27 
 
 
625 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  28.93 
 
 
216 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0730  cytochrome c-type biogenesis protein (CcdA)  31.96 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000473312 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3524  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.06 
 
 
242 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239201  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4600  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.06 
 
 
242 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  33.18 
 
 
622 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.87 
 
 
238 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.61 
 
 
466 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.61 
 
 
466 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  32.24 
 
 
469 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  34.08 
 
 
237 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  31.65 
 
 
604 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  31.12 
 
 
592 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.65 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.65 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.21 
 
 
403 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.76 
 
 
403 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.78 
 
 
609 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  31.51 
 
 
591 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.54 
 
 
231 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.52 
 
 
247 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0130  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.25 
 
 
228 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2512  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
244 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  30 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  23.61 
 
 
242 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.63 
 
 
227 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0681  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.36 
 
 
229 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.07 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.45 
 
 
218 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2559  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.97 
 
 
239 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608237  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.48 
 
 
253 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.4 
 
 
237 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.08 
 
 
236 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.81 
 
 
246 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.34 
 
 
589 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.69 
 
 
249 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.89 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.89 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.38 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  30.88 
 
 
589 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3156  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.11 
 
 
242 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132612  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.56 
 
 
598 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 
249 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.03 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1899  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.3 
 
 
215 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.19 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2721  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.72 
 
 
245 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0697099  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17960  cytochrome c biogenesis protein  31.18 
 
 
256 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.38 
 
 
251 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.06 
 
 
225 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.17 
 
 
256 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  29.93 
 
 
222 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.93 
 
 
222 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.98 
 
 
224 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.93 
 
 
235 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.78 
 
 
242 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0334  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  32.19 
 
 
237 aa  46.6  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.32 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  24.32 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  33.1 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.23 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.32 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  29.82 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.32 
 
 
235 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  24.32 
 
 
235 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.32 
 
 
235 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.88 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.88 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.88 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.33 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  29.82 
 
 
248 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.32 
 
 
235 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.32 
 
 
235 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.87 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.19 
 
 
257 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.15 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.91 
 
 
227 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.92 
 
 
244 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0211  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.38 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  27.46 
 
 
197 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>