90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0929 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0929  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 376 aa  730    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.505775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1482  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  61.28 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.13 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0540  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.34 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0674  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.58 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0634  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.28 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0779825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3524  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.86 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2721  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.04 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0697099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4600  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.86 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0187  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.85 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.698131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.3 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.28 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  28.37 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2559  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.55 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5137  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.24 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140315  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.61 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0130  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.44 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0211  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.16 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.88 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  32.39 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3390  putative cytochrome c-type biogenesis protein  32 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.927366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0947  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.19 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000313224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  28.91 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.43 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.43 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.34 
 
 		 227 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1726  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.56 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.78327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30 
 
 		 623 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  26.89 
 
 		 691 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  27.53 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.94 
 
 		 242 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.99 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.34 
 
 		 626 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  32.37 
 
 		 604 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  30.16 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30.16 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5438  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.78 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249555  hitchhiker  0.00388506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.43 
 
 		 619 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.21 
 
 		 703 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.43 
 
 		 619 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  31.21 
 
 		 622 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0334  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  33.33 
 
 		 237 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  26.5 
 
 		 695 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.69 
 
 		 625 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.92 
 
 		 619 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5394  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.76 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.53 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  28.24 
 
 		 592 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  32.95 
 
 		 591 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0730  cytochrome c-type biogenesis protein (CcdA)  30.39 
 
 		 340 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000473312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.53 
 
 		 609 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.76 
 
 		 709 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.76 
 
 		 709 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.35 
 
 		 622 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2512  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.94 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2354  cytochrome c biogenesis protein  26.87 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000264437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.57 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4594  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.46 
 
 		 250 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  32.41 
 
 		 589 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.27 
 
 		 237 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.36 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.36 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.36 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.28 
 
 		 247 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.82 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.93 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.95 
 
 		 631 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.1 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.57 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  24 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.58 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.59 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.58 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.51 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 		 236 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.92 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  23.3 
 
 		 630 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1604  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.9 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1670  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.9 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.78 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  30.3 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.13 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.74 
 
 		 570 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1725  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.96 
 
 		 243 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.25 
 
 		 253 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.87 
 
 		 266 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.41 
 
 		 243 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3156  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.56 
 
 		 242 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.19 
 
 		 223 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0681  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.99 
 
 		 229 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>