70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1726 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1726  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 411 aa  808    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.78327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.68 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0540  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.72 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0674  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.72 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0634  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.17 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0779825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4600  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.54 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3524  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.54 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  28.1 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2559  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.74 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  32.85 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5137  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.82 
 
 		 242 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140315  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.72 
 
 		 244 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  29.86 
 
 		 248 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1482  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.86 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0334  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  29.79 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.57 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  33.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  31.25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.58 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2721  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.33 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0697099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.95 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.34 
 
 		 247 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.11 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.11 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.02 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  26.22 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0187  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.21 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.698131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.7 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.74 
 
 		 253 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.74 
 
 		 248 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0947  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.11 
 
 		 239 aa  50.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000313224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  25.78 
 
 		 403 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2354  cytochrome c biogenesis protein  28.02 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000264437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.83 
 
 		 235 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.91 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.76 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.96 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.82 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.25 
 
 		 214 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.47 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.81 
 
 		 235 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28 
 
 		 247 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  27.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 531 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 566 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 531 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.79 
 
 		 237 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  26.79 
 
 		 237 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 576 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 534 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 531 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 556 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3390  putative cytochrome c-type biogenesis protein  28.67 
 
 		 239 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.927366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.36 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.21 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1109  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.73 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.36 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.7 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.78 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  26.75 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.92 
 
 		 247 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.98 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.16 
 
 		 231 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5438  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.19 
 
 		 239 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249555  hitchhiker  0.00388506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>