59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1058 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1058  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0495  putative lipoprotein  69.59 
 
 
177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0231  putative lipoprotein  64.46 
 
 
182 aa  225  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1603  putative lipoprotein  58.43 
 
 
182 aa  222  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1454  putative lipoprotein  62.26 
 
 
178 aa  218  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0467  putative lipoprotein  59.41 
 
 
182 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3103  hypothetical protein  62.42 
 
 
177 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259811  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5881  putative lipoprotein  63.4 
 
 
186 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2392  putative lipoprotein  60 
 
 
178 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2965  putative lipoprotein  58.58 
 
 
178 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3177  lipoprotein  56.6 
 
 
178 aa  190  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2515  lipoprotein, putative  53.45 
 
 
177 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2730  putative lipoprotein  55.97 
 
 
178 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430324  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3024  hypothetical protein  55.97 
 
 
178 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.750227  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2326  putative lipoprotein  51.74 
 
 
177 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6101  putative lipoprotein  52.47 
 
 
178 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0127542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2706  hypothetical protein  45.93 
 
 
181 aa  177  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0570453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1174  hypothetical protein  49.69 
 
 
182 aa  174  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764093  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2808  putative lipoprotein  49.43 
 
 
180 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1244  hypothetical protein  49.07 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.360902  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3376  hypothetical protein  50 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1173  hypothetical protein  48.45 
 
 
182 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000305778  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3046  hypothetical protein  49.04 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1317  hypothetical protein  49.04 
 
 
181 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.392601  normal  0.0822966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3060  hypothetical protein  49.04 
 
 
181 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3203  hypothetical protein  49.04 
 
 
181 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.805935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1894  putative lipoprotein  46.24 
 
 
178 aa  166  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1484  hypothetical protein  46.89 
 
 
176 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3028  hypothetical protein  47.31 
 
 
214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0116343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1006  hypothetical protein  46.55 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2769  hypothetical protein  45.66 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171621  normal  0.264035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0727  hypothetical protein  49.15 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1487  hypothetical protein  43.2 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0819  hypothetical protein  48.75 
 
 
173 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1324  putative lipoprotein  45.57 
 
 
185 aa  158  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0869  hypothetical protein  42.2 
 
 
167 aa  153  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.553116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1386  lipoprotein, putative  49.35 
 
 
159 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3365  hypothetical protein  39.87 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1374  putative lipoprotein  39.66 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03341  lipoprotein  41.86 
 
 
185 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0643  putative lipoprotein  43.12 
 
 
175 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.114374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01821  hypothetical protein  38.92 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0310  hypothetical protein  40.48 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2838  putative lipoprotein  39.31 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000947276  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0639  hypothetical protein  37.71 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232095  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4067  putative lipoprotein  36.25 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003858  putative lipoprotein  41.86 
 
 
129 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.671366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3890  putative lipoprotein  37.43 
 
 
194 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0370  hypothetical protein  34.13 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0409  hypothetical protein  31.9 
 
 
189 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63828  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1088  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2923  hypothetical protein  31.85 
 
 
159 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2940  hypothetical protein  34.64 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0504763  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2751  hypothetical protein  33.96 
 
 
186 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224395  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2548  hypothetical protein  29.94 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1899  hypothetical protein  31.21 
 
 
158 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3325  hypothetical protein  28.83 
 
 
171 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0084  hypothetical protein  34.78 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3399  hypothetical protein  31.82 
 
 
159 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>