59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0231 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0231  putative lipoprotein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1454  putative lipoprotein  69.81 
 
 		 178 aa  244  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2965  putative lipoprotein  69.28 
 
 		 178 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2392  putative lipoprotein  68.71 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1603  putative lipoprotein  62.57 
 
 		 182 aa  228  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0467  putative lipoprotein  61.33 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5881  putative lipoprotein  67.1 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1058  hypothetical protein  64.46 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0495  putative lipoprotein  61.11 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2515  lipoprotein, putative  53.12 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2326  putative lipoprotein  53.75 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3103  hypothetical protein  55.7 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2706  hypothetical protein  47.02 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0570453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3046  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3203  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.805935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3060  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1317  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.392601  normal  0.0822966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0819  hypothetical protein  50.31 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2730  putative lipoprotein  51.9 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3024  hypothetical protein  51.9 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.750227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1174  hypothetical protein  46.58 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1244  hypothetical protein  45.96 
 
 		 182 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.360902  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2808  putative lipoprotein  49.07 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6101  putative lipoprotein  45.71 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0127542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3177  lipoprotein  50.32 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3028  hypothetical protein  45 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0116343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1173  hypothetical protein  45.34 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000305778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3376  hypothetical protein  48.68 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1487  hypothetical protein  42.46 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1006  hypothetical protein  43.79 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1484  hypothetical protein  45 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1386  lipoprotein, putative  53.64 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1894  putative lipoprotein  45 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2769  hypothetical protein  43.12 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171621  normal  0.264035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1324  putative lipoprotein  42.95 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3365  hypothetical protein  42.04 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0310  hypothetical protein  42.78 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0869  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.553116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2838  putative lipoprotein  39.01 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000947276  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0727  hypothetical protein  43.17 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0639  hypothetical protein  41.18 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4067  putative lipoprotein  38.99 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03341  lipoprotein  36.96 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1374  putative lipoprotein  39.2 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01821  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3890  putative lipoprotein  40.94 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0643  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.114374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0409  hypothetical protein  38.1 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003858  putative lipoprotein  39.2 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.671366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1088  hypothetical protein  35.36 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2940  hypothetical protein  37.91 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0504763  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0370  hypothetical protein  37.66 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2751  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1899  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0084  hypothetical protein  32.93 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2923  hypothetical protein  29.49 
 
 		 159 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2548  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3399  hypothetical protein  28.85 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3325  hypothetical protein  27.56 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>