59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0310 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0310  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0639  hypothetical protein  63.01 
 
 		 175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2965  putative lipoprotein  44.77 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0231  putative lipoprotein  42.78 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2392  putative lipoprotein  45.34 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3103  hypothetical protein  42.5 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1603  putative lipoprotein  42.77 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0727  hypothetical protein  44.83 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2769  hypothetical protein  42.22 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171621  normal  0.264035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0467  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1894  putative lipoprotein  39.43 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2730  putative lipoprotein  41.88 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1454  putative lipoprotein  43.4 
 
 		 178 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3024  hypothetical protein  41.25 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.750227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2515  lipoprotein, putative  40 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2326  putative lipoprotein  40 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1487  hypothetical protein  41.07 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0495  putative lipoprotein  38.37 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1484  hypothetical protein  39.88 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1058  hypothetical protein  40.72 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5881  putative lipoprotein  40.52 
 
 		 186 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3365  hypothetical protein  37.97 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3177  lipoprotein  38.99 
 
 		 178 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03341  lipoprotein  36.84 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1324  putative lipoprotein  39.61 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1386  lipoprotein, putative  44.74 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1374  putative lipoprotein  35.12 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1006  hypothetical protein  36.05 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2706  hypothetical protein  34.52 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0570453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2808  putative lipoprotein  36.97 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1244  hypothetical protein  32.6 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.360902  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1174  hypothetical protein  33.15 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1173  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000305778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3028  hypothetical protein  35.12 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0116343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1317  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.392601  normal  0.0822966 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6101  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 178 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0127542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3203  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.805935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3060  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0643  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.114374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3046  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01821  hypothetical protein  30.64 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3376  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0084  hypothetical protein  38.01 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0819  hypothetical protein  34.59 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0869  hypothetical protein  31.45 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.553116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4067  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2923  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2548  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2838  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000947276  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003858  putative lipoprotein  36.13 
 
 		 129 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.671366  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0409  hypothetical protein  32.67 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3890  putative lipoprotein  33.92 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3399  hypothetical protein  30.94 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3325  hypothetical protein  28.17 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1899  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0370  hypothetical protein  28.99 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1088  hypothetical protein  27.43 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2751  hypothetical protein  28.48 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2940  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0504763  normal  0.191467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>