59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0467 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0467  putative lipoprotein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2965  putative lipoprotein  62.5 
 
 		 178 aa  224  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0231  putative lipoprotein  61.33 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2392  putative lipoprotein  65.62 
 
 		 178 aa  220  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1454  putative lipoprotein  61.39 
 
 		 178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5881  putative lipoprotein  63.64 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1603  putative lipoprotein  52.81 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0495  putative lipoprotein  56.98 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1058  hypothetical protein  59.41 
 
 		 177 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3103  hypothetical protein  54.09 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2769  hypothetical protein  45.98 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171621  normal  0.264035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2706  hypothetical protein  48.12 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0570453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2515  lipoprotein, putative  46.75 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1894  putative lipoprotein  46.86 
 
 		 178 aa  168  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2808  putative lipoprotein  48.75 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0727  hypothetical protein  47.46 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2326  putative lipoprotein  46.15 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3046  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3028  hypothetical protein  44.75 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0116343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1317  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.392601  normal  0.0822966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3060  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3203  hypothetical protein  47.17 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.805935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0819  hypothetical protein  49.37 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1173  hypothetical protein  44.77 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000305778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1244  hypothetical protein  44.77 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.360902  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1386  lipoprotein, putative  52.6 
 
 		 159 aa  164  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1174  hypothetical protein  44.77 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1006  hypothetical protein  44.19 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6101  putative lipoprotein  45.35 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0127542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1487  hypothetical protein  45.68 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3376  hypothetical protein  47.06 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3365  hypothetical protein  42.41 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0869  hypothetical protein  42.33 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.553116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1374  putative lipoprotein  40.59 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3024  hypothetical protein  45.22 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.750227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3177  lipoprotein  43.95 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2730  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 178 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1324  putative lipoprotein  41.4 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01821  hypothetical protein  42.5 
 
 		 172 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1484  hypothetical protein  45.57 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0639  hypothetical protein  41.48 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0643  putative lipoprotein  42.14 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.114374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0310  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4067  putative lipoprotein  36.31 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03341  lipoprotein  37.36 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3890  putative lipoprotein  39.11 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0370  hypothetical protein  35.98 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0409  hypothetical protein  36.54 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2838  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000947276  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2940  hypothetical protein  39.1 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0504763  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003858  putative lipoprotein  45.3 
 
 		 129 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.671366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1088  hypothetical protein  37.18 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2751  hypothetical protein  37.18 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0084  hypothetical protein  36.43 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2923  hypothetical protein  29.41 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2548  hypothetical protein  28.1 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1899  hypothetical protein  27.45 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3399  hypothetical protein  25.32 
 
 		 159 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3325  hypothetical protein  26.35 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>