59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1088 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1088  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2751  hypothetical protein  97.85 
 
 		 186 aa  339  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2940  hypothetical protein  85.48 
 
 		 186 aa  328  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0504763  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0370  hypothetical protein  69.81 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0409  hypothetical protein  56.33 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0467  putative lipoprotein  37.18 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1454  putative lipoprotein  37.18 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2965  putative lipoprotein  35.26 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2392  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0495  putative lipoprotein  37.11 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3376  hypothetical protein  34.87 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1374  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1173  hypothetical protein  32.75 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000305778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1244  hypothetical protein  32.75 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.360902  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3103  hypothetical protein  38.41 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3060  hypothetical protein  34 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3046  hypothetical protein  32.91 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3203  hypothetical protein  34 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.805935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1317  hypothetical protein  32.91 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.392601  normal  0.0822966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2769  hypothetical protein  32.03 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171621  normal  0.264035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0231  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2706  hypothetical protein  32.28 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0570453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1487  hypothetical protein  32.89 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3028  hypothetical protein  32.93 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0116343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5881  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4067  putative lipoprotein  34.9 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1006  hypothetical protein  31.95 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3177  lipoprotein  36.84 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2808  putative lipoprotein  35.57 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1324  putative lipoprotein  33.79 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01821  hypothetical protein  30.63 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3365  hypothetical protein  27.45 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3024  hypothetical protein  34.87 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.750227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1386  lipoprotein, putative  32.03 
 
 		 159 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2730  putative lipoprotein  34.21 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0869  hypothetical protein  28.66 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.553116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3890  putative lipoprotein  35.03 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03341  lipoprotein  30.17 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6101  putative lipoprotein  34.9 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0127542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1603  putative lipoprotein  32.32 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2515  lipoprotein, putative  31.54 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2326  putative lipoprotein  31.54 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0643  putative lipoprotein  30.72 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.114374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0819  hypothetical protein  32.45 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1058  hypothetical protein  34.59 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1894  putative lipoprotein  29.24 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2838  putative lipoprotein  33.57 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000947276  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003858  putative lipoprotein  32.28 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.671366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0639  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0727  hypothetical protein  28.33 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0084  hypothetical protein  30.6 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0310  hypothetical protein  27.43 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2548  hypothetical protein  25.81 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2923  hypothetical protein  26.45 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3325  hypothetical protein  27.03 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1899  hypothetical protein  25.81 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3399  hypothetical protein  25.81 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>