45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1008 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  83.68 
 
 
399 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  781    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  92.8 
 
 
375 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  38.58 
 
 
357 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  39.17 
 
 
367 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  36.87 
 
 
357 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  35.77 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  36.5 
 
 
359 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  36.28 
 
 
343 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  33.52 
 
 
350 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  36.61 
 
 
330 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  34.37 
 
 
329 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  33.23 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  32.36 
 
 
359 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  30.64 
 
 
338 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  31.1 
 
 
341 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  32.45 
 
 
332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  30.57 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  27.98 
 
 
353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  24.76 
 
 
342 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  30.94 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  27.21 
 
 
342 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0606  hypothetical protein  29.11 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  23.91 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  28.79 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  29.69 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  26.42 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  25.45 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  26.09 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  26.59 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  34.54 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  26.53 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  24.78 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  27.91 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  27.75 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  23.89 
 
 
320 aa  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  24.69 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2016  putative outer membrane protein  30.09 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0652398  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1843  putative outer membrane protein  30.09 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1425  putative outer membrane protein  30.09 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0236408  decreased coverage  0.000268777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1457  hypothetical protein  30.09 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0584255  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1442  hypothetical protein  30.09 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0887  putative outer membrane protein  24.35 
 
 
319 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  25.81 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>