41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2256 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  100 
 
 		 328 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  54.22 
 
 		 343 aa  318  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  49.33 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  40.24 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  42.81 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  45.57 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  37.36 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  36.39 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  37.5 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  36.79 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  36.86 
 
 		 365 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  36.59 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  36.39 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  33.88 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  33.23 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  32.94 
 
 		 375 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  32.94 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  33.72 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0606  hypothetical protein  33.23 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  33.66 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  29.36 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  31.33 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  28.32 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  26.14 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  28.3 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  28.3 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  28.03 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  27.22 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  30.57 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  25.23 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  25.68 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  26.95 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  32.22 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  25.23 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  26.07 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  34.52 
 
 		 179 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  28.69 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  21.7 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  26.11 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0400  hypothetical protein  28.49 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.431693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0887  putative outer membrane protein  23.61 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>