38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3530 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  742    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  54.06 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  50.88 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  38.94 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  39.47 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  39.17 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  37.97 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  38.41 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  35.99 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  36.56 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  32.38 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  35.45 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  35.44 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  34.6 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  34.71 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  34.13 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  32.66 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  33.72 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  29.81 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  26.61 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  28.67 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  24.62 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  26.9 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  28.31 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  29.18 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  24.38 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  25.95 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0606  hypothetical protein  27.74 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  25.65 
 
 		 325 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  30.08 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  26.89 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  25.77 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  22.92 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  28.65 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  31.38 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  24.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  22.48 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  22.79 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.955633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>