38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1384 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  61.41 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  52.2 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  44.55 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  35.03 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  32.91 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  32.24 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  32.52 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  24.35 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  29.6 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  28.31 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  26.86 
 
 		 357 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  25.66 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  26.71 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  25.23 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  30.61 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  27.12 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  27.81 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  24.3 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  25.48 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  27.58 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  25.07 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  25.16 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  28.12 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  31.52 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  25.45 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  25.89 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  24.78 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  24.91 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  27.56 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  29.03 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  26.97 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  25.24 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  24.92 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  33.02 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  25.5 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  24.29 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>