29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0175 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  26.07 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  24.72 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  25.07 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  26.05 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  24.5 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  24.43 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  23.72 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  24.63 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  23.41 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  21.72 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  26.63 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  21.73 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  26.67 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  26.98 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  23.16 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  23.42 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  22.53 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  26.59 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  25.25 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  20.69 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  21.82 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  24.85 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  24.19 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  21.01 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0606  hypothetical protein  23.03 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  25.81 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  20.83 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  23.16 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>