45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0569 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  735    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  44.38 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  39.88 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  38.01 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  36.31 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  37.01 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  35.16 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  37.58 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  36.79 
 
 		 328 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  35.4 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  36.52 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  38.12 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  36.76 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  31.5 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  32.66 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  30.37 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  33.03 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  30.45 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0606  hypothetical protein  33.87 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  31.79 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  29.73 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  26.1 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  27.78 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  28.04 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  27.11 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  30.61 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  26.14 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  27.2 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  26.54 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  28.09 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  25.08 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0887  putative outer membrane protein  28.37 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1843  putative outer membrane protein  28.18 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2016  putative outer membrane protein  28.18 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0652398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1425  putative outer membrane protein  28.18 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0236408  decreased coverage  0.000268777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1457  hypothetical protein  28.18 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0584255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1442  hypothetical protein  28.18 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  33.13 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  28.31 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  25.13 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  26.67 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  23.12 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.955633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>