45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1261 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  92.8 
 
 		 380 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  83.2 
 
 		 399 aa  663    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  38.28 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  37.11 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  39.47 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  36.04 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  35.01 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  34.1 
 
 		 382 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  34.83 
 
 		 329 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  33.24 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  36.9 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  35.69 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  32.94 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  31.78 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  30.57 
 
 		 338 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  31.69 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  32.15 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  29.56 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0606  hypothetical protein  29.97 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  30.94 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  25.41 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  29.7 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  26.4 
 
 		 342 aa  86.3  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  27.18 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  23.62 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  30.74 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  25.89 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  25.72 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  26.55 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  35.03 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  26.47 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  27.56 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  28.32 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  22.83 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  26.64 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  24.59 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2016  putative outer membrane protein  26.55 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0652398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1843  putative outer membrane protein  26.55 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1425  putative outer membrane protein  26.55 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0236408  decreased coverage  0.000268777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1457  hypothetical protein  26.55 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0584255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1442  hypothetical protein  26.55 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  24.19 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0887  putative outer membrane protein  25.22 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>