31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1425 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2016  putative outer membrane protein  99.69 
 
 
319 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0652398  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1843  putative outer membrane protein  100 
 
 
319 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1425  putative outer membrane protein  100 
 
 
319 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0236408  decreased coverage  0.000268777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1457  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0584255  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1442  hypothetical protein  99.69 
 
 
319 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0887  putative outer membrane protein  72.01 
 
 
319 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  23.91 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  30.16 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  23.81 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  27.31 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  25.86 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  27.12 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  26.36 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  24.08 
 
 
357 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  27.44 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  24.03 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  24.55 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  24.32 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  26.41 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  32 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  24.53 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  25.64 
 
 
338 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  30.09 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  26.55 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  26.98 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  27.55 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  23.4 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  25.57 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  28.16 
 
 
399 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  25 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  25.14 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>