31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2016 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2016  putative outer membrane protein  100 
 
 		 319 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0652398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1843  putative outer membrane protein  99.69 
 
 		 319 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1425  putative outer membrane protein  99.69 
 
 		 319 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0236408  decreased coverage  0.000268777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1457  hypothetical protein  99.69 
 
 		 319 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0584255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1442  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0887  putative outer membrane protein  71.7 
 
 		 319 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  30.16 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  23.91 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  23.81 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  27.31 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  27.12 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  28.18 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  26.36 
 
 		 353 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  24.08 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  27.44 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  24.03 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  24.32 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  24.55 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  25.96 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  24.53 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  25.64 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  30.09 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  26.55 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  26.98 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  27.55 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  23.4 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  25.57 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  28.16 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  25.14 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>