38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1241 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  52 
 
 		 332 aa  358  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  53.38 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  42.61 
 
 		 344 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  31.6 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  31.45 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  30.56 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  24.2 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  30.07 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  28.47 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  29.17 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  29.18 
 
 		 367 aa  95.9  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  26.32 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  26.32 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  25.16 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  26.97 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  27.59 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  36.75 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  26.54 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  24.41 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  24.61 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  27.43 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  26.53 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  26.47 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  22.95 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  25.18 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  26.45 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  27.46 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  23.91 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  23.68 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  25.22 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  21.91 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  26.7 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  24.25 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  22.07 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>